Suomen ensimmäinen jalkapalloluokka aloitti koulussamme syksyllä 1999. Liikuntaluokallamme annetaan ammattimaista jalkapallovalmennusta. Valmennuksesta vastaa 3 valmentajaa, joista 1 on myös maalivahtivalmentaja. Lisäksi futistunneilla loukkaantuneita pelaajia auttaa fysio. Liikuntaluokalle otetaan sekä tyttöjä että poikia. Tarjoamme jalkapallovalmennusta kerran viikossa joka luokka-asteella. Liikuntaluokalla oppilaalla on mahdollisuus liikuntaan valintansa mukaisesti 8-9 tuntia viikossa luokka-asteesta riippuen. Näistä 2 tuntia on koulun ammattimaista jalkapallovalmennusta Pallomyllyssä, 1 tunti yleisliikuntaa monipuolisella lajivalikoimalla ja 1 tunti kehonhallintaa kehittävää lihaskuntoharjoittelua ja juoksuvalmennusta sekä telinevoimistelua puoli vuotta pienemmissä ryhmissä. Torstaiaamuisin koulu tarjoaa jalkapallovalmennusta niille oppilaille, joilla ei ole mahdollisuutta seuran aamuharjoitteluun. Urhea-yhteistyönä lajiliittojen ja/tai urheiluseurojen järjestämiin aamuharjoituksiin on mahdollisuus osallistua viikoittain tiistaisin ja torstaisin. Koulu on mukana kehittämässä Urhea-yhteistyötä koko Helsingin alueella. Urhea-yhteistyö mukaan lukien koulupäivän aikana oppilaalla voi olla liikuntaa enimmillään yhdeksän tuntia viikossa. Koulussamme voidaan tehdä Urhean urheilijasopimus myös sellaisen oppilaan kanssa, joka ei opiskele liikuntaluokalla, jos hän harrastaa aktiivisesti jotain muuta lajia kuin jalkapalloa. Liikuntaluokka antaa myös mahdollisuuden harrastaa normaalia enemmän muita liikuntalajeja ja tutustua uusiin lajeihin, kuten seinäkiipeilyyn ja melontaan. Herttoniemen yhteiskoulun ympäristö ja Viikin viheralue tarjoaa liikkumiselle otolliset harjoitusolosuhteet: urheilupuisto sijaitsee aivan koulun vieressä, koululla on tilava liikuntasali ja erinomainen kuntosali. Käytämme lisäksi hyödyksi lähiympäristön liikuntapaikkoja, kuten Myllypuron tennis-, sulka- ja jalkapallohallia, Liikuntamyllyä, Myllypuron salibandyareenaa ja Herttoniemen yksityistä kuntosalia. Herttoniemen yhteiskoulu on yksityinen sopimuskoulu, jossa opetus on maksutonta. Samassa kiinteistössä toimivat perusopetuksen 7. – 9. luokat ja lukio. Oppilaita ja opiskelijoita on yhteensä noin 700. Koulussa on hyvä henki ja meillä on turvallista opiskella. Koulutaloa on laajennettu 2000-luvun alussa ja luokkatilat on saneerattu. Käytössä ovat nykyaikaiset opetusvälineet ja oma kuntosali.
